Для нахождения координат подводной лодки был создан корабельный навигационный комплекс, позволявший определять местонахождение лодки с точностью до 1 км. Эта ошибка прямо входила, отклонение боеголовки от цели, что было одной из основных причин низкой точности ракет "Поларис" первых модификаций.
Невысокая точность первых БРПЛ предопределила интенсивный поиск путей решения навигационной задачи, а в дальнейшем и переход к новым типам систем управления полетом БРПЛ. Ракеты устанавливались в пусковые шахты, встроенные в корпус лодки. Шахты были закрыты крышками, обеспечивавшими герметизацию полости шахт при подводном положении ПЛ. Запуск ракет был возможен с глубины до 30 м и осуществлялся сжатым воздухом.
Перед пуском ракеты давление в шахте выравнивалось с забортным, затем крышка открывалась и доступ воде преграждался лишь тонкой пластиковой диафрагмой. Действием сжатого воздуха, подаваемого в полость под ракетой, она выбрасывалась из шахты и выходила из-под воды. На высоте 20-30 м включался двигатель первой ступени, и ракета начинала полет по АУТ.
Система управления ракетной стрельбой обеспечила старт первой ракеты через 15 мин после принятия решения на пуск. Пуски следующих ракет могли производиться с интервалом в одну минуту. Большое внимание при создании ПЛАРБ уделялось обеспечению безопасности в период хранения ракет и при их пуске.
ПЛ были снабжены автоматическими системами, обеспечивающими непрерывный контроль за техническим состоянием ракет. Вслед за серией ПЛ "Джордж Вашингтон" было построено пять ПЛАРБ "Итэн Аллен", на которых размещались БР "Поларис А2". Эти лодки имели несколько большие размеры и водоизмещение.